Untuk semakin meningkatkan keimanan guru dan siswa, SMP 2 mengadakan pesantren kilat bagi kelas 8. Acara tersebut diadakan pada hari Sabtu-Minggu (11-12 April 2019) bertempat di SMP Negeri 2 Yogyakarta. Acara dibuka oleh bapak kepala sekolah, Bapak Widayat Umar, lalu dilanjutkan membaca Alquran bersama siswa. Selain itu, juga diadakan Pildacil (Pemilihan Dai Cilik) bagi siswa, yang dimenangkan juara 1-3 oleh Sean (8C), Divas (8E), Sendy (8G).