Proses Penerimaan Peserta Didik Baru (PPDB) tahun ini dirasa sulit oleh para orang tua siswa. Selain karena masih dalam masa pandemi COVID-19, juga dikarenakan sistem PPDB full online ini baru dilaksanakan untuk pertama kalinya. Untuk itu, SMP Negeri 2 Yogyakarta membuka layanan bantuan mengenai PPDB khususnya pengajuan akun yang sudah dilaksanakan sejak tanggal 1 – 7 Juni 2020. Operator sekolah yakni Bapak Didik Setyawan, Bapak Sakir Marwanto, dan Ibu Heni Pratiwi bertugas dalam memverifikasi pengajuan akun dari siswa.
Dalam rentang waktu tersebut, tim PPDB SMP Negeri 2 siap sedia melayani masyarakat yang mencari info, menanyakan status verifikasi akun, bahkan ada yang sampai selesai aktivasi dan login. Namun, layanan di sekolah ini hanya berlangsung di hari kerja yakni hingga tanggal 5 Juni 2020, dan sisanya dilakukan verifikasi di rumah operator sekolah masing-masing.
Berikut jadwal lengkap waktu pemilihan sekolah atau dapat dilihat di website https://yogya.siap-ppdb.com/